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日志

 
 

Two Python scripts for making a mutation of a nucleotide sequence  

2010-11-07 00:37:47|  分类: Script |  标签: |举报 |字号 订阅

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There are two types of a mutation of a gene, one is substitution and the other is frameshift mutation. Sometimes, I need to mutate a nucleotide base of specific position and this task is easy. I wrote two Python scripts for these two mutations:

frameshift_mutation-1.0.py : Make a frameshift mutation, insertion and deletion.
ubstitution_mutation-1.0.py : Make a substitution mutation, such as A-->G.

All the scripts can be downloaded from here: http://code.google.com/p/bifscripts/downloads/list .
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